Turun kauppakorkeakoulu on mukana useissa valtakunnallisissa tutkijakoulutusohjelmissa:
- KATAJA Kauppatieteiden valtakunnallinen jatkokoulutusohjelma/The Finnish Doctoral Program in Business Studies
- KAVA Kansantaloustieteen valtakunnallinen jatkokoulutusohjelma/The Finnish Doctoral Program in Economics
- TUCS Turku Centre for Computer Science
- RYM-TO Rakennetun ympäristön tutkijaohjelma/The Doctoral Program of the Built Environment
- FDPSS The Finnish Doctoral Programme in Stochastics and Statistics